Там в том числе находятся пароли. В репозитории в этом файле пароли закрыты звездочками. После синхронизации в локальной версии я поменял обратно на нормальные пароли. И теперь задача состоит в том, чтобы этот файл не предлагался для коммита каждый раз, когда я комичу всю папку с проектом. Согласно этой статье игнор уже не будет работать.А приведенный пример с git rm помечает этот файл как удаленный и опять же предлагает для коммита.