Есть несколько вариантов решения Вашего вопроса(в зависимости от конкретной ситуации). Один из вариантов- через суд признать факт фактического принятия наследства Вашим отцом второй части дома(та что завещалась сестре). По закону после смерти своей матери он является наследником первой очереди. Если он принял наследство на свою долю дома, то скорее всего пользовался и долей дома, завещенной сестре: например, оплачивал налоги, коммунальные платежи, повесил замок на дом, возделывал земельный участок и т.д. Важно, чтобы такие действия он делал в течении 6 месяцев со дня смерти бабушки. Нужно найти свидетелей, которые подтвердят факт принятия наследства(второй части дома), письменные, вещественные доказательства.  Суд выносит решение. С решением в Регистрационную службу- отцу дадут свидетельство на право собственности. Можно будет весь дом продать. При Вашем желании могу помочь составить заявление в суд.