Вирус - вопрос №441570

1 -  стоит проверить на вирусы дополнительными специальными бесплатными средствами не конфликтующими с постоянно установленным антивирусом

http://support.kaspersky.ru/viruses/avptool2011?level=2

http://www.freedrweb.com/livecd/?lng=ru 

второе средство осбенно желательно — это загрузочный диск, если система заражена, вирусы не смогут обороняться и прятаться при проверке с загрузочного диска

там же есть ссылка на вариант для флешки

http://www.freedrweb.com/liveusb

2 — если постоянного антивируса нет — установить обязательно. но эт оне отменяет проверку средсвами из пункта 1

3 — отдельно по поводу «невидимости» — попробуйте в фаре, в командной строке в корне проблемного диска, выполнить переход в известную Вам папку

cd <имя папки>

если имя папки содержит пробелы — все имя следует взять в кавычки - «имя папки»

если внутри папки фар «увидит» файлы, следует проверить свойства безопасности корневой паки диска

если нет права на просмотр списка содержимого корневой папки — будет в точности такой эффект как Вы описываете