В вашей организации есть положение о премиальных выплатах, которое и содержит все условия назначения, изменения размера или лишения работников премии.
Вам нужно ознакомиться с данным положением и если лишение годовой премии при наличии взыскания противоречит условиям данного документа, вы вправе обжаловать действия работодателя в ГИТ либо в судебном порядке.