выход из ООО - Читинская область - вопрос №484299

Возможно налоговая неправильно трактует закон об ООО (такое бывает)

п.6 ст. 24 ФЗ «Об ООО»

6. Орган, осуществляющий государственную регистрацию юридических лиц, должен быть извещен о состоявшемся переходе к обществу доли или части доли в уставном капитале общества не позднее чем в течение месяца со дня перехода к обществу доли или части доли путем направления заявления о внесении соответствующих изменений в единый государственный реестр юридических лиц и документа, подтверждающего основания перехода к обществу доли или части доли. 

Так вот, в Вашем случае, таким документом будет заявление от Вас, как от участника, о выходе из Общества, направленное в адрес Общества. На заявлении должна быть отметка когда  заявление поступило. (может быть дата, печать, подпись ген.директора). Потому что именно с даты поступления прекращаются Ваши права на долю для остальных участников Общества, а для третьих лиц (банков и.т.д) эти изменения вступят в силу только после регистрации в налоговой.